Öffne ich zuerst eine Dos-Box mittels "Start->Ausführen->cmd" und starte dann dort die Batch-Datei klappt alles ohne Probleme.
Es ist auch egal welche Befehle in der Batch-Datei ausgeführt werden sollen.
Als Test habe ich dazu mal eine hallo.bat erstellt in der nur steht:
echo hallo
Windows 7 x64, alle MS Patches installiert, kein Virus/Trojaner oder Schadsoftware.
Ich hoffe ihr könnt mir helfen.